Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CipcQ8R0W1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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