Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Colec12Q8K4Q8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms