Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hecw1Q8K4P8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms