Protein–RNA interactions for Protein: Q8K424

Trpv3, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 3, mousemouse

Predictions only

Length 791 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv3Q8K424 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms