Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N7

Vmn1r72, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r72Q8K3N7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms