Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrtm1Q8K377 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms