Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssh3Q8K330 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms