Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y7

Mrpl47, 39S ribosomal protein L47, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl47Q8K2Y7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl47Q8K2Y7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms