Protein–RNA interactions for Protein: Q8K203

Neil3, Endonuclease 8-like 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil3Q8K203 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms