Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek9Q8K1R7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek9Q8K1R7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek9Q8K1R7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek9Q8K1R7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek9Q8K1R7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek9Q8K1R7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek9Q8K1R7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek9Q8K1R7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek9Q8K1R7 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek9Q8K1R7 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek9Q8K1R7 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek9Q8K1R7 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek9Q8K1R7 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek9Q8K1R7 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek9Q8K1R7 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek9Q8K1R7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek9Q8K1R7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek9Q8K1R7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek9Q8K1R7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek9Q8K1R7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek9Q8K1R7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek9Q8K1R7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek9Q8K1R7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek9Q8K1R7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek9Q8K1R7 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek9Q8K1R7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek9Q8K1R7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek9Q8K1R7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek9Q8K1R7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek9Q8K1R7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek9Q8K1R7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek9Q8K1R7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek9Q8K1R7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek9Q8K1R7 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek9Q8K1R7 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek9Q8K1R7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek9Q8K1R7 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek9Q8K1R7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek9Q8K1R7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek9Q8K1R7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek9Q8K1R7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek9Q8K1R7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek9Q8K1R7 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek9Q8K1R7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek9Q8K1R7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek9Q8K1R7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek9Q8K1R7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek9Q8K1R7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek9Q8K1R7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek9Q8K1R7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek9Q8K1R7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek9Q8K1R7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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