Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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