Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkn3Q8K045 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms