Protein–RNA interactions for Protein: Q8K021

Scamp1, Secretory carrier-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp1Q8K021 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scamp1Q8K021 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms