Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CopaQ8CIE6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms