Protein–RNA interactions for Protein: Q8CG79

Tp53bp2, Apoptosis-stimulating of p53 protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp2Q8CG79 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tp53bp2Q8CG79 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms