Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Ercc8Q8CFD5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ercc8Q8CFD5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ercc8Q8CFD5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ercc8Q8CFD5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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