Protein–RNA interactions for Protein: Q8CF98

Colec10, Collectin-10, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec10Q8CF98 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Colec10Q8CF98 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms