Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc28aQ8CEI3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms