Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc17Q8CE13 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc17Q8CE13 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms