Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc87Q8CDL9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms