Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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