Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ephb1Q8CBF3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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