Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bhlhe22Q8C6A8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms