Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5P7

Tdrp, Testis development-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdrpQ8C5P7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TdrpQ8C5P7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TdrpQ8C5P7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TdrpQ8C5P7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TdrpQ8C5P7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TdrpQ8C5P7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TdrpQ8C5P7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TdrpQ8C5P7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TdrpQ8C5P7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TdrpQ8C5P7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TdrpQ8C5P7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TdrpQ8C5P7 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TdrpQ8C5P7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TdrpQ8C5P7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TdrpQ8C5P7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TdrpQ8C5P7 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TdrpQ8C5P7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TdrpQ8C5P7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TdrpQ8C5P7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TdrpQ8C5P7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TdrpQ8C5P7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TdrpQ8C5P7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TdrpQ8C5P7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TdrpQ8C5P7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TdrpQ8C5P7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TdrpQ8C5P7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TdrpQ8C5P7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TdrpQ8C5P7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TdrpQ8C5P7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TdrpQ8C5P7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TdrpQ8C5P7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TdrpQ8C5P7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TdrpQ8C5P7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms