Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Gm37026-201ENSMUST00000191917 535 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 AC153544.1-201ENSMUST00000217988 400 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Gm20063-201ENSMUST00000220757 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Klrc2-201ENSMUST00000071920 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Vmn1r210-201ENSMUST00000072044 921 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Gm12073-201ENSMUST00000117382 524 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Olfr772-201ENSMUST00000169800 1004 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Gm13147-202ENSMUST00000177526 1173 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Zcchc10-201ENSMUST00000018383 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Fam122c-203ENSMUST00000186314 898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Gm45488-201ENSMUST00000210747 371 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Gm40646-201ENSMUST00000218243 490 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Ctsll3-201ENSMUST00000043754 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 1810022K09Rik-202ENSMUST00000185384 435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Trim35Q8C006 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Samd13-204ENSMUST00000147113 729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim35Q8C006 Olfr184-ps1-201ENSMUST00000205922 516 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
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