Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms