Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Cldn17Q8BXA6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Cldn17Q8BXA6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Cldn17Q8BXA6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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