Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ube3dQ8BX13 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ube3dQ8BX13 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ube3dQ8BX13 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ube3dQ8BX13 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ube3dQ8BX13 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ube3dQ8BX13 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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