Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TtpaQ8BWP5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TtpaQ8BWP5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TtpaQ8BWP5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TtpaQ8BWP5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TtpaQ8BWP5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TtpaQ8BWP5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TtpaQ8BWP5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TtpaQ8BWP5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TtpaQ8BWP5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TtpaQ8BWP5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TtpaQ8BWP5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TtpaQ8BWP5 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TtpaQ8BWP5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TtpaQ8BWP5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TtpaQ8BWP5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TtpaQ8BWP5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TtpaQ8BWP5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TtpaQ8BWP5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TtpaQ8BWP5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TtpaQ8BWP5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TtpaQ8BWP5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TtpaQ8BWP5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TtpaQ8BWP5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TtpaQ8BWP5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms