Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Zfp398Q8BV16 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Zfp398Q8BV16 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Zfp398Q8BV16 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Zfp398Q8BV16 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Zfp398Q8BV16 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Zfp398Q8BV16 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfp398Q8BV16 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfp398Q8BV16 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfp398Q8BV16 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfp398Q8BV16 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfp398Q8BV16 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfp398Q8BV16 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfp398Q8BV16 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfp398Q8BV16 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfp398Q8BV16 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfp398Q8BV16 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfp398Q8BV16 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfp398Q8BV16 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfp398Q8BV16 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfp398Q8BV16 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfp398Q8BV16 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfp398Q8BV16 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfp398Q8BV16 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfp398Q8BV16 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfp398Q8BV16 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfp398Q8BV16 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfp398Q8BV16 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfp398Q8BV16 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfp398Q8BV16 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfp398Q8BV16 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfp398Q8BV16 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zfp398Q8BV16 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfp398Q8BV16 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfp398Q8BV16 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfp398Q8BV16 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfp398Q8BV16 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfp398Q8BV16 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfp398Q8BV16 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfp398Q8BV16 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfp398Q8BV16 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfp398Q8BV16 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfp398Q8BV16 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfp398Q8BV16 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfp398Q8BV16 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfp398Q8BV16 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfp398Q8BV16 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfp398Q8BV16 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfp398Q8BV16 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfp398Q8BV16 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfp398Q8BV16 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfp398Q8BV16 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfp398Q8BV16 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfp398Q8BV16 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfp398Q8BV16 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfp398Q8BV16 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfp398Q8BV16 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms