Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Pggt1bQ8BUY9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Pggt1bQ8BUY9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Pggt1bQ8BUY9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms