Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup54Q8BTS4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms