Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSU2

Cxcl16, C-X-C motif chemokine 16, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl16Q8BSU2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl16Q8BSU2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cxcl16Q8BSU2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cxcl16Q8BSU2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl16Q8BSU2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl16Q8BSU2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl16Q8BSU2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl16Q8BSU2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl16Q8BSU2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl16Q8BSU2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl16Q8BSU2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl16Q8BSU2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl16Q8BSU2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl16Q8BSU2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl16Q8BSU2 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl16Q8BSU2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl16Q8BSU2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl16Q8BSU2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl16Q8BSU2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl16Q8BSU2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl16Q8BSU2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl16Q8BSU2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl16Q8BSU2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl16Q8BSU2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl16Q8BSU2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl16Q8BSU2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl16Q8BSU2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl16Q8BSU2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl16Q8BSU2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl16Q8BSU2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl16Q8BSU2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl16Q8BSU2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl16Q8BSU2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl16Q8BSU2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms