Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSQ9

Pbrm1, Protein polybromo-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbrm1Q8BSQ9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pbrm1Q8BSQ9 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pbrm1Q8BSQ9 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pbrm1Q8BSQ9 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pbrm1Q8BSQ9 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pbrm1Q8BSQ9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pbrm1Q8BSQ9 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pbrm1Q8BSQ9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pbrm1Q8BSQ9 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pbrm1Q8BSQ9 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pbrm1Q8BSQ9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pbrm1Q8BSQ9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pbrm1Q8BSQ9 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Pbrm1Q8BSQ9 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pbrm1Q8BSQ9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pbrm1Q8BSQ9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms