Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms