Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smarcal1Q8BJL0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms