Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHH8

Clrn3, Clarin-3, mousemouse

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Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3Q8BHH8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Clrn3Q8BHH8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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