Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Liat1Q810M6 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Liat1Q810M6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms