Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChfrQ810L3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms