Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Smim19Q80ZU4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim19Q80ZU4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms