Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34b3Q80ZS5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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