Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbbp8Q80YR6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbbp8Q80YR6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbbp8Q80YR6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbbp8Q80YR6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbbp8Q80YR6 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbbp8Q80YR6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbbp8Q80YR6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbbp8Q80YR6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbbp8Q80YR6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbbp8Q80YR6 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbbp8Q80YR6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbbp8Q80YR6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbbp8Q80YR6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbbp8Q80YR6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbbp8Q80YR6 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbbp8Q80YR6 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbbp8Q80YR6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbbp8Q80YR6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbbp8Q80YR6 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbbp8Q80YR6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbbp8Q80YR6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbbp8Q80YR6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbbp8Q80YR6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbbp8Q80YR6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbbp8Q80YR6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbbp8Q80YR6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbbp8Q80YR6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbbp8Q80YR6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbbp8Q80YR6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbbp8Q80YR6 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbbp8Q80YR6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbbp8Q80YR6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbbp8Q80YR6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbbp8Q80YR6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbbp8Q80YR6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbbp8Q80YR6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rbbp8Q80YR6 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbbp8Q80YR6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms