Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Kdm5bQ80Y84 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms