Protein–RNA interactions for Protein: Q80VK6

Arhgef38, Rho guanine nucleotide exchange factor 38, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef38Q80VK6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Arhgef38Q80VK6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Arhgef38Q80VK6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Arhgef38Q80VK6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Arhgef38Q80VK6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Arhgef38Q80VK6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Arhgef38Q80VK6 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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Arhgef38Q80VK6 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Arhgef38Q80VK6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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