Protein–RNA interactions for Protein: Q80UU2

Rpp38, Ribonuclease P protein subunit p38, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpp38Q80UU2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpp38Q80UU2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms