Protein–RNA interactions for Protein: Q80TS8

Sel1l3, Protein sel-1 homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sel1l3Q80TS8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sel1l3Q80TS8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms