Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms