Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Actn1Q7TPR4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms