Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prrc2bQ7TPM1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms