Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPD6

Raver2, Ribonucleoprotein PTB-binding 2, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raver2Q7TPD6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Raver2Q7TPD6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Raver2Q7TPD6 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Raver2Q7TPD6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Raver2Q7TPD6 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Raver2Q7TPD6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Raver2Q7TPD6 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Raver2Q7TPD6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Raver2Q7TPD6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Raver2Q7TPD6 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Raver2Q7TPD6 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Raver2Q7TPD6 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Raver2Q7TPD6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Raver2Q7TPD6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Raver2Q7TPD6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Raver2Q7TPD6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Raver2Q7TPD6 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Raver2Q7TPD6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Raver2Q7TPD6 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Raver2Q7TPD6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Raver2Q7TPD6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Raver2Q7TPD6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Raver2Q7TPD6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Raver2Q7TPD6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Raver2Q7TPD6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Raver2Q7TPD6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms